Der FC Stammheim führt Juniorenteams in folgenden Kategorien:
| Junioren A | Jahrgänge 2006 und 2007 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Aktuell haben wir kein A-Junioren Team. Die Spieler dieser Jahrgänge werden in die Aktiv-Teams integriert. |
| Betreuer: | |
| Kontakt: | |
| Junioren B | Jahrgänge 2008 bis 2010 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Montag und Donnerstag, 19.00 - 20.30 Uhr |
| Betreuer: | Mischa Burkhart, Ralf Peter |
| Kontakt: | Ralf Peter, 079 614 73 71 |
| Junioren C | Jahrgänge 2011 und 2012 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Dienstag und Donnerstag, 18.30 - 20.00 Uhr |
| Betreuer: | Christian Renold, Patrick Stäheli |
| Kontakt: | Patrick Stäheli, 079 318 65 35 |
| Junioren D9a | Jahrgänge 2013 bis 2015 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Montag und Mittwoch, 18.30 - 20.00 Uhr |
| Betreuer: | Beni Windler, Roman Gentsch, Sven Voss |
| Kontakt: | Beni Windler, 079 354 15 17 |
| Junioren D9b | Jahrgänge 2013 bis 2015 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Dienstag und Donnerstag, 18.30 - 20.00 Uhr |
| Betreuer: | Yves Meier, Christoph Schiess |
| Kontakt: | Yves Meier, 079 775 40 67 |
| Junioren D7a | Jahrgänge 2014 bis 2015 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Dienstag und Donnerstag, 18.30 - 20.00 Uhr |
| Betreuer: | Matthias Sonderegger, Simone Dimasi, Jérôme Schiesser |
| Kontakt: | Matthias Sonderegger, 079 476 26 63 |
| Junioren D7b | Jahrgänge 2014 bis 2015 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Montag und Mittwoch, 18.30 - 20.00 Uhr |
| Betreuer: | Pedro Vicente, Alexander Abbruzzo, Vincent Leumann |
| Kontakt: | Pedro Vicente, 079 276 42 76 |
| Junioren Ea | Jahrgänge 2016 und 2017 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Mittwoch und Freitag, 18.15 - 19.45 Uhr |
| Betreuer: | Gafur Ceka, David, Meier, Leon Lanz |
| Kontakt: | Gafur Ceka, 076 570 74 40 |
| Junioren Eb | Jahrgänge 2016 und 2017 |
| Trainingsort: | Schelmengrube Oberstammheim |
| Trainingszeit: | Mittwoch und Freitag, 18.15 - 19.45 Uhr |
| Betreuer: | Gian-Andrea Eberle, Claudio Peter, Pascal Gentsch |
| Kontakt: | Gian-Andrea Eberle, 079 223 38 00 |
| Junioren Ec | Jahrgänge 2016 und 2017 |
| Trainingsort: | Sekwiese Unterstammheim (Mittwoch) / Schelmengrube Oberstammheim (Freitag) |
| Trainingszeit: | Mittwoch und Freitag, 18.15 - 19.45 Uhr |
| Betreuer: | Reto Bächli, Roger Windler |
| Kontakt: | Reto Bächli, 079 406 01 64 |
| Junioren F | Jahrgänge 2018 und 2019 |
| Trainingsort: | Sekwiese Unterstammheim |
| Trainingszeit: | Mittwoch, 18.00 - 19.30 Uhr |
| Betreuer: | Michi Frei, Stephan Räss, Priska Frei, Martin Frei, Stefan Pfister |
| Kontakt: | Michi Frei, 078 645 47 29 / Stephan Räss, 079 348 67 23 |
| Junioren G | Jahrgänge 2020 und 2021 |
| Trainingsort: | Sekwiese Unterstammheim |
| Trainingszeit: | Dienstag, 17.45 - 19.15 Uhr |
| Betreuer: | Sandra Bosshard, Rebecca Reolon |
| Kontakt: | Sandra Bosshard, 078 810 76 32 |